中國醫院的一流專科代表了該專科的頂尖水平，反映了中國在該專科領域的臨床實力和學術聲譽。複旦大學醫院管理研究所從2010年開始，每年推出上一年度的《中國醫院最佳專科聲譽排行榜》和《中國最佳醫院排行榜》評比。這裏收集的研究所2012年發布的.
| 病理科 | 醫院 |
| 1 | 複旦大學附屬腫瘤醫院 |
| 2 | 北京協和醫院 |
| 3 | 四川大學華西醫院 |
| 4 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 5 | 北京大學第三醫院 |
| 6 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 7 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 8 | 南京軍區南京總醫院 |
| 9 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 10 | 中國醫學科學院腫瘤醫院 |
| 傳染科 | 醫院 |
| 1 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京地壇醫院 |
| 3 | 浙江大學醫學院附屬第一醫院 |
| 4 | 中國人民解放軍第三零二醫院 |
| 5 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 6 | 南方醫科大學南方醫院 |
| 7 | 首都醫科大學附屬北京佑安醫院 |
| 8 | 中山大學附屬第三醫院 |
| 9 | 上海市（複旦大學附屬）公共衛生臨床中心 |
| 10 | 北京大學第一醫院 |
| 耳鼻喉科 | 醫院 |
| 1 | 複旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京同仁醫院 |
| 3 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 4 | 北京協和醫院 |
| 5 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 6 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 7 | 上海交通大學醫學院附屬新華醫院 |
| 8 | 山東省立醫院 |
| 9 | |
| 10 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 並10 | 中南大學湘雅醫院 |
| 放射科 | 醫院 |
| 1 | 四川大學華西醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 3 | 北京協和醫院 |
| 4 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 5 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 6 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 7 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 8 | 首都醫科大學宣武醫院 |
| 並8 | 中國醫科大學附屬第一醫院 |
| 10 | 中國醫科大學附屬盛京醫院 |
| 呼吸科 | 醫院 |
| 1 | 廣州醫學院第一附屬醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 3 | 北京協和醫院 |
| 4 | 四川大學華西醫院 |
| 5 | 首都醫科大學附屬北京朝陽醫院 |
| 6 | 中國醫科大學附屬第一醫院 |
| 7 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 8 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 9 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 10 | 北京大學第一醫院 |
| 風濕病 | 醫院 |
| 1 | 北京協和醫院 |
| 2 | 上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院 |
| 3 | 北京大學人民醫院 |
| 4 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 5 | 南京大學醫學院附屬鼓樓醫院 |
| 6 | 中山大學附屬第三醫院 |
| 7 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 8 | 四川大學華西醫院 |
| 9 | 中日友好醫院 |
| 10 | 第二軍醫大學長征醫院 |
| 婦產科 | 醫院 |
| 1 | 北京協和醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬婦產科醫院 |
| 3 | 浙江大學醫學院附屬婦產科醫院 |
| 4 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 5 | 北京大學人民醫院 |
| 6 | 四川大學華西第二醫院 |
| 7 | 山東大學齊魯醫院 |
| 8 | 北京大學第一醫院 |
| 9 | 北京大學第三醫院 |
| 10 | 中國醫科大學附屬盛京醫院 |
| 骨科 | 醫院 |
| 1 | 北京積水潭醫院 |
| 2 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 3 | 北京大學第三醫院 |
| 4 | 上海交通大學醫學院附屬第六人民醫院 |
| 5 | 北京協和醫院 |
| 6 | 四川大學華西醫院 |
| 7 | 第二軍醫大學長征醫院 |
| 8 | 北京大學人民醫院 |
| 9 | 南京大學醫學院附屬鼓樓醫院 |
| 10 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 精神醫學 | 醫院 |
| 1 | 北京大學第六醫院 |
| 2 | 上海市精神衛生中心 |
| 3 | 中南大學湘雅二醫院 |
| 4 | 四川大學華西醫院 |
| 5 | 首都醫科大學附屬北京安定醫院 |
| 6 | 南京醫科大學附屬腦科醫院 |
| 7 | 廣州市腦科醫院 |
| 8 | 北京回龍觀醫院 |
| 9 | 武漢大學人民醫院 |
| 10 | 深圳市康寧醫院 |
| 口腔科 | 醫院 |
| 1 | 北京大學口腔醫院 |
| 2 | 四川大學華西口腔醫院 |
| 3 | 上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院 |
| 4 | 第四軍醫大學口腔醫院 |
| 5 | 武漢大學口腔醫學院 |
| 6 | 中山大學光華口腔醫學院附屬口腔醫院 |
| 7 | 首都醫科大學附屬北京口腔醫院 |
| 8 | 廣東省口腔醫院 |
| 9 | 南京市口腔醫院 |
| 10 | 中國醫科大學附屬口腔醫院 |
| 麻醉科 | 醫院 |
| 1 | 四川大學華西醫院 |
| 2 | 北京協和醫院 |
| 3 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 4 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 5 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 6 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 7 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 8 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 9 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 10 | 中南大學湘雅醫院 |
| 泌尿外科 | 醫院 |
| 1 | 北京大學第一醫院 |
| 2 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 3 | 第二軍醫大學長海醫院 |
| 4 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 5 | 四川大學華西醫院 |
| 6 | 北京協和醫院 |
| 7 | 天津醫科大學第二醫院 |
| 8 | 中山大學孫逸仙紀念醫院 |
| 9 | 上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院 |
| 10 | 浙江大學醫學院附屬第一醫院 |
| 內分泌 | 醫院 |
| 1 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 2 | 北京協和醫院 |
| 3 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 4 | 中南大學湘雅二醫院 |
| 5 | 上海交通大學醫學院附屬第六人民醫院 |
| 6 | 四川大學華西醫院 |
| 7 | 中國醫科大學附屬第一醫院 |
| 8 | 中日友好醫院 |
| 9 | 北京大學第一醫院 |
| 10 | 中山大學孫逸仙紀念醫院 |
| 皮膚科 | 醫院 |
| 1 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 2 | 中國醫學科學院皮膚病醫院（研究所） |
| 3 | 北京大學第一醫院 |
| 4 | 中國醫科大學附屬第一醫院 |
| 5 | 安徽醫科大學第一附屬醫院 |
| 6 | 北京協和醫院 |
| 7 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 8 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 9 | 中南大學湘雅二醫院 |
| 10 | 杭州市第三人民醫院 |
| 普通外科 | 醫院 |
| 1 | 北京協和醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 3 | 四川大學華西醫院 |
| 4 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 5 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 6 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 7 | 北京大學人民醫院 |
| 8 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 9 | 浙江大學醫學院附屬第一醫院 |
| 10 | 南京軍區南京總醫院 |
| 神經內科 | 醫院 |
| 1 | 北京協和醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 3 | 首都醫科大學宣武醫院 |
| 4 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 5 | 四川大學華西醫院 |
| 6 | 首都醫科大學附屬北京天壇醫院 |
| 7 | 吉林大學第一醫院 |
| 8 | 中南大學湘雅醫院 |
| 9 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 10 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 並10 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 腎髒病 | 醫院 |
| 1 | 北京大學第一醫院 |
| 2 | 南京軍區南京總醫院 |
| 3 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 4 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 5 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 6 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 7 | 北京協和醫院 |
| 8 | 南方醫科大學南方醫院 |
| 9 | 第二軍醫大學長征醫院 |
| 10 | 四川大學華西醫院 |
| 神經外科 | 醫院 |
| 1 | 首都醫科大學附屬北京天壇醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬華山醫院 |
| 3 | 四川大學華西醫院 |
| 4 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 5 | 天津醫科大學總醫院 |
| 6 | 首都醫科大學宣武醫院 |
| 並6 | 中南大學湘雅醫院 |
| 8 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 9 | 哈爾濱醫科大學附屬第一醫院 |
| 10 | 山東大學齊魯醫院 |
| 消化病 | 醫院 |
| 1 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 2 | 北京協和醫院 |
| 3 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 4 | 上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院 |
| 5 | 第二軍醫大學長海醫院 |
| 6 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 7 | 南方醫科大學南方醫院 |
| 8 | 首都醫科大學附屬北京友誼醫院 |
| 9 | 中山大學附屬第一醫院 |
| 10 | 四川大學華西醫院 |
| 小兒內科 | 醫院 |
| 1 | 複旦大學附屬兒科醫院 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京兒童醫院 |
| 3 | 浙江大學醫學院附屬兒童醫院 |
| 4 | 重慶醫科大學附屬兒童醫院 |
| 5 | 上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心 |
| 6 | 北京大學第一醫院 |
| 7 | 四川大學華西第二醫院 |
| 8 | 上海交通大學醫學院附屬新華醫院 |
| 並8 | 首都兒科研究所 |
| 10 | 中國醫科大學附屬盛京醫院 |
| 小兒外科 | 醫院 |
| 1 | 首都醫科大學附屬北京兒童醫院 |
| 2 | 複旦大學附屬兒科醫院 |
| 3 | 中國醫科大學附屬盛京醫院 |
| 4 | 上海交通大學醫學院附屬新華醫院 |
| 5 | 重慶醫科大學附屬兒童醫院 |
| 6 | 華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院 |
| 7 | 上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心 |
| 8 | 廣州市婦女兒童醫療中心 |
| 9 | 首都兒科研究所 |
| 10 | 浙江大學醫學院附屬兒童醫院 |
| 心血管病 | 醫院 |
| 1 | 中國醫學科學院阜外心血管病醫院 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京安貞醫院 |
| 3 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 4 | 廣東省人民醫院 |
| 5 | 北京大學人民醫院 |
| 6 | 北京大學第一醫院 |
| 7 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 8 | 沈陽軍區總醫院 |
| 9 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 10 | 四川大學華西醫院 |
| 心外科 | 醫院 |
| 1 | 中國醫學科學院阜外心血管病醫院 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京安貞醫院 |
| 3 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 並3 | 廣東省人民醫院 |
| 5 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 6 | 四川大學華西醫院 |
| 7 | 上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心 |
| 8 | 中南大學湘雅二醫院 |
| 9 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 10 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 胸外科 | 醫院 |
| 1 | 中國醫學科學院腫瘤醫院 |
| 2 | 同濟大學附屬上海市肺科醫院 |
| 3 | 上海市胸科醫院 |
| 4 | 四川大學華西醫院 |
| 5 | 北京大學人民醫院 |
| 6 | 複旦大學附屬中山醫院 |
| 7 | 廣州醫學院第一附屬醫院 |
| 8 | 中山大學腫瘤防治中心 |
| 9 | 天津市胸科醫院 |
| 10 | 第四軍醫大學唐都醫院 |
| 血液學 | 醫院 |
| 1 | 中國醫學科學院血液學研究所 |
| 2 | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 |
| 3 | 北京大學人民醫院 |
| 4 | 蘇州大學附屬第一醫院 |
| 5 | 浙江大學醫學院附屬第一醫院 |
| 6 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 7 | 北京協和醫院 |
| 8 | 四川大學華西醫院 |
| 9 | 中國人民解放軍總醫院 |
| 10 | 山東大學齊魯醫院 |
| 眼科 | 醫院 |
| 1 | 中山大學中山眼科中心 |
| 2 | 首都醫科大學附屬北京同仁醫院 |
| 3 | 複旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院 |
| 4 | 天津市眼科醫院 |
| 5 | 溫州醫學院附屬眼視光醫院 |
| 6 | 北京大學人民醫院 |
| 7 | 北京協和醫院 |
| 8 | 北京大學第三醫院 |
| 9 | 浙江大學醫學院附屬第二醫院 |
| 10 | 山東省眼科研究所 |
| 整形外科 | 醫院 |
| 1 | 上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院 |
| 2 | 中國醫學科學院整形外科醫院 |
| 3 | 第四軍醫大學西京醫院 |
| 4 | 第三軍醫大學西南醫院 |
| 5 | 北京大學第三醫院 |
| 6 | 南方醫科大學南方醫院 |
| 7 | 第二軍醫大學長海醫院 |
| 8 | 北京協和醫院 |
| 9 | 第二軍醫大學長征醫院 |
| 10 | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 腫瘤 | 醫院 |
| 1 | 中國醫學科學院腫瘤醫院 |
| 2 | 中山大學腫瘤防治中心 |
| 3 | 複旦大學附屬腫瘤醫院 |
| 4 | 天津醫科大學附屬腫瘤醫院 |
| 5 | 北京大學腫瘤醫院 |
| 6 | 山東省腫瘤醫院 |
| 7 | 浙江省腫瘤醫院 |
| 8 | 哈爾濱醫科大學附屬腫瘤醫院 |
| 9 | 四川大學華西醫院 |
| 10 | 江蘇省腫瘤醫院 |
