在國民革命軍的編製序列中，曆史上曾先後出現過3個第98軍。
一、第82師、新編第193師組成的第98軍
該軍前身一部是湖北警備旅。1933年月，湖北警備旅與何成浚第3軍團一部合編組成第82師。1937年7月，抗日戰爭全麵爆發後，第82師編入預備第4軍。1938年6月，預備第4軍第82師與新編第193師合編組成第98軍，隸屬第32軍團。第31集團軍總司令湯恩伯兼任軍長。同年7月，張剛接任軍長，鄭洞國任副軍長。下轄：
第82師，羅啟疆任師長；
第193師，李宗鑒任師長。
改軍編成後，先後參加了徐州會戰、武漢會戰等作戰。1939年1月，國民黨軍進行編製調整時該軍番號被撤消，所轄第82師改隸第92軍、第193師改隸第13軍。
二、西北軍楊虎城一部組成的的第98軍
該軍前身是西北軍楊虎城所屬陝軍一部。1936年13月，西安事變結束後，西北軍楊虎城所屬陝軍被國民黨軍事委員會改編為第42師、第169師，隸屬第27路軍。抗日戰爭爆發後，第42師、第169師改隸第14軍團。1939年3月，以第42師、第169師合編為第 98軍，隸屬於第14集團軍。由第14集團軍代總司令馮欽哉兼任軍長，柳彥彪兼任副軍長。下轄：
第42師，柳彥彪兼任師長；
第169師。武士敏任師長。
同年10月，馮欽哉免去兼職，武士敏接任軍長。12月，該軍參加了冬季攻勢作戰。1940年，該軍改隸屬第5集團軍，下轄第42師、第169師編製不變。 1941年5月，該軍在晉南會戰中，被日軍重兵圍困在中條山區，遭受重大傷亡，後在八路軍掩護下撤往太嶽解放區。同年9月，日軍兵分九路對太嶽解放區進行大“掃蕩”時，該君與八路軍工同展開反“掃蕩”作戰。
三、第32集團軍突擊總隊組成的的第98軍
該軍前身是第32集團軍李默庵部所轄的突擊總隊。1945年9月，國民黨第3戰區將第32集團軍李默庵部所轄的突擊總隊改編為第98師，隸屬第32集團軍，段霖茂任軍長，下轄：
第117師，廖運升任師長；
預備第3師，魏人鑒任師長；
預備第4師，曹耀祖任師長。
該軍編成後在江蘇徐州、安徽碭山地區駐防。
1946年5月，國民黨軍隊進行整編時，第98軍改編為整編第57師，段霖茂任師長，原下轄第117師改編為整編第 117旅，廖運升任旅長；預備第3師改編為預備第3旅，魏人鑒任旅長；預備第4師改編為預備第4旅，曹耀祖任旅長。該師改編後，即調至江蘇東海連雲港，擔任守備並維護隴後海路東段交通。同年12月，該整編師為解救整編第69師之圍，調預備第3旅奉命增援宿遷，在宿遷附近被人民解放軍殲滅，該旅番號取消。 1947年，該師改隸屬陸軍總司令部臨沂指揮部時，預備第4旅改番號位第60旅。此時該師下轄整編第60旅，曹耀祖任旅長。整編第117旅，廖運升任旅長；同年，國民黨軍對山東解放區發動重點進攻後，該師先後參加了泰蒙戰役、孟良崮戰役、沙土集戰役等作戰。9月，該整編師在沙土集戰役中被解放軍全殲，中將師長段霖茂、少將政治部主任李梯青等被俘。
1948年春，國民黨軍在川東地區重建整編第57師，隸屬重慶綏靖公署。劉勁持任師長，下轄：整編第60旅，李亦煒任旅長；整編第117旅，羅覺元任旅長。1948年9月，整編第57師恢複第98軍番號，劉勁持任軍長，原整編第60旅、整編第117旅恢複整編第60 師、整編第117師。同年11月，第60師改隸屬川鄂邊綏靖公署，另將第158師劃歸第98軍建製。此時，該軍下轄：
第117師，羅覺元任師長；
第158 師，朱則鳴任師長。
1949年上半年，該軍由四川調至陝南，擔負安康地區守備任務，同年7月至12月，該軍先後參加了隴陝戰役和西南戰役等作戰。12月 25日，該軍在四川閬中南部地區參加了由第7兵團司令長官裴昌會組織的起義，接受解放軍的改編。
