該軍前身是原建國豫軍樊鍾秀舊部。1930年春，中原大戰爆發後，原原建國豫軍總司令樊鍾秀召集舊部參與反蔣，被馮玉祥、閻錫山委任為第8方麵軍總指揮。同年5月25日，樊鍾秀陣亡後，所屬部隊被張鈁收編後改編為第68師，1931年番號為第76師，先後隸屬第20路軍和第12軍團。
1937年8月，抗日戰爭全麵爆發後，國民黨軍進行整編時，以第12軍團第76師為基礎，在浙江擴編組成為第79 軍，夏楚中任軍長。下轄：
第76師，張鈁任師長。
該軍組成後，隸屬第32集團軍，參加了淞滬會戰。在淞滬會戰後，第54軍第98師和第67軍第108師編入該軍，此時，該軍下轄：
第76師，王淩雲任師長；
第98師，王甲本任師長；
第108師，張文清任師長。
1938年6月，該軍調至湖北參加了武漢會戰。在武漢會戰後，該軍原轄第108師改隸第25軍。1939年初，新組建的第118師編入該軍，王嚴任師長。此時，該軍下轄第76師、第98師、第118師。同年春，該軍改隸第9戰區後，先後參加了南昌會戰，第一次長沙會戰和1939年冬季攻勢作戰。
1940年春，該軍進行整編時，原轄第76師改隸第2軍，第118師改隸第87軍，另將第92軍第82師、新編第6 軍暫編第6師、第10軍第79師改隸該軍。不久，第79師改隸第86軍。至此，改軍下轄：
第82師，羅啟疆任師長；
第98師，王甲本兼任師長；
暫編第6 師，龍雲飛任師長。
此次整編後，該軍由國民黨軍事委員會直轄，在湖南寧鄉整訓。1941年下半年，該軍改隸第9戰區後再次進行編製調整，第82師改隸第 20集團軍直轄，另將第19集團軍直轄的第194師改隸該軍。此次編製調整後，該軍先後參加了第2次、第3次長沙會戰和浙贛會戰。
1943年3月，該軍隸屬第10集團軍時，夏楚中升任第10集團軍副總司令，王甲本繼任軍長，郭禮伯、甘登俊任副軍長。此時，該軍下轄：
第98師，向思敏任師長；
第194師，龔傳文任師長；
暫編第6師，趙季平任師長。
此後至1945年12月，該軍先後參加了鄂西會戰、常德會戰、常衡會戰和桂柳會戰等。在常衡會戰後期，軍長王甲本在湖南省東安地區與日軍作戰中殉國，方靖繼任軍長。1945年4月，該軍由廣西調至四川內江地區休整時，第93軍暫編第2師改隸第79軍。同年6月，該軍暫編第6師被裁減。此時，該軍下轄：
第98師，向思敏任師長；
第194師，龔傳文任師長；
暫編第2師，曾晴初任師長。
抗日戰爭勝利後，該軍隸屬國民黨軍事委員會直轄，移防四川宜賓地區，擔任後方守備任務。1947年，該軍改隸重慶行營時，將暫編第2師改稱第189師。此時，該軍下轄第98師、第189師、第194師。同年底，該軍由四川調往陝西，改隸西安綏靖公署。1948年春，該軍改編為整編第79師，軍長方靖改任師長，下轄第98改編為整編第98旅，胡一任旅長；第194師改編為整編第194旅，向思敏任旅長。同時將原轄第 189師裁減，士兵分別補入整編第98旅、整編第194旅。同年9月，該師恢複第79軍番號，方靖任軍長，下轄整編第98旅恢複第98師，胡一任師長；整編第194旅恢複第194師，傅傳文任師長。11月，人民解放軍發起淮海戰役後，國民黨軍為增強華中地區防禦力量，將該軍由陝西調至湖北，隸屬華中“剿匪”總司令部。1949年2月，該軍在荊門戰役中，其軍部及所轄第98師大部被解放軍殲滅，中將軍長方靖被俘。此次作戰後，該軍重建軍部和第98師，由龔傳文繼任軍長。同時將新建第199師編入該軍。此時，該軍下轄：
第98師，胡一任師長；
第194師，傅傳文任師長；
第199師，肖炳宣任師長。
同年7 月，該軍先後編入宋希濂兵團和第14兵團，在參加宜沙戰役後，退往川東地區。1949年11月，該軍第98師、第199師在西南戰役中被人民解放軍全殲。殘部逃到川東忠縣時，改隸第16兵團指揮，並將第110軍第140師改隸該軍。12月21日，該軍在川西什邡縣隨川鄂邊綏靖公署副主任董綜衍和第16兵團副司令曾蘇元起義，接受解放軍改編。
