神藉著萬有創造向人啟示自己，更藉著耶穌基督(參照聖經記載)向人啟示自己。科學研究的課題，是神在大自然的普通啟示；神學研究的課題，是神藉著耶穌基督、藉著聖經賜給世人的特殊啟示。
論到神在大自然的普通啟示，詩人說：
諸天述說神的榮耀，
穹蒼傳揚他的手段，
這日到那日發出言語，
這夜到那夜傳出知識，
無言無語，
也無聲音可聽，
他的量帶通遍天下，
他的言語傳到地極。
(詩篇19：1-4)
使徒保羅也說過類似的話：“自從造天地以來，神的永能和神性是明明可知的，雖是眼不能見，但藉著所造之物就可以曉得，叫人無可推諉。”(羅馬書1：20；也參看使徒行傳14：17；17：22-28)
有些基督徒(如：十八世紀的佩裏［William Paley］)認為“自然神學”已足以證明神存在，他們的意思是：人從萬有創造的普通啟示，可以得出“神存在”的證據。可是“自然神學”似乎說得過了頭——比較穩妥的說法，是神在他創造的世界處處留下點點線索，讓人可以查究他的存在與性情。下麵我們要看兩個例子。
第一個例子：凡事皆有因，如果一直追溯上去，至終會得出“第一因”。可能很多人聽過這個故事：有一個人在倫敦海德公園攻擊有神論，他大聲宣稱萬事發生無緣無由，根本沒有邏輯可言，說話之際，有人向他丟蕃茄。“是誰幹的好事？”他氣呼呼的吼道。人群中一把聲音回答說：“沒有人用蕃茄打你啊——那蕃茄自己飛過去罷了！”
上述例子不是“神存在”的證據，卻可引發人思索“神存在”的問題。以我自己來說，我比較容易接受“神從無有創造萬有”，而難以接受“萬有都是無中生有”。達爾文(Charles Darwin)在年邁之日寫下這樣的話：“這茫茫無邊、美麗動人的宇宙(還有住在其中的人類)，實在不可能是盲目碰撞、機遇巧合的結果。我再三思量，不得不相信‘第一因’的實在，這第一因滿有智能(與人相仿)，我甚至要自稱為有神論者了。”
另一個例子：凡事皆有設計。這也不是“神存在”的證據，卻是很好的線索。來自佛教背景的域甘馬辛爾(Chandrs Wickramasinghe)說：“生命在世上偶然發生的機率，就像一場台風猛吹一處垃圾場，竟然把肥料打成一架波音七四七客機一般的不可思議。”
“設計論”近年談論得很多，可能因為“人類定律”(anthropic Principle)時興所致。所謂“人類定律”，是說人類存在的物理條件寬容度極低，隻要有絲毫差異，生命根本不會出現。
在宇宙膨脹初期，張力(使物質分散)與引力(使物質聚合)的平衡非常關鍵：如果張力過大，物質散開的速度過高，物質就難以凝聚成星體，更遑論銀河了。如果物質過度分崩離析，就不可能出現生命——但如果引力過大，導致宇宙內陷塌掉，生命也不可能出現。事實上，在宇宙誕生之初，張力、引力的差異不可超過10的60次分之一。識數之人會被這數字嚇得目瞪口呆，至於不識數之人，讓我借用戴維斯(Paul Davies)的一個比喻來說明這是怎麽樣的精確度：就像要從二百二十億光年(已知宇宙的闊度)之外，打中一個直徑半英寸的目標！
霍金說：
在大爆炸發生之後一秒，如果宇宙的密度多一萬億分之一，宇宙就會在十年後內陷塌掉；但如果少了一萬億分之一，宇宙在就會在十年後散得空空如也。宇宙起初的密度怎會那樣精確？這背後一定有原因。
雖然霍金不相信世上有創造主，但他的理論卻隱隱指向有神論。
除了生命的出現叫人驚歎，世上還有很多事物，譬如：人類智能、自然秩序、友誼、公義、美、愛，都叫人難以用純科學觀點來闡釋。上述種種都不過是自然率的產品、物競天擇的結果嗎？世事背後真的沒有任何智能與心思嗎？
科學可以成為導引人尋找神的明燈。人可以從普通啟示思索神的大能、智能、心思，但如果沒有耶穌基督與聖經的特殊啟示，人對神的知識仍是非常有限。
信奉猶太教的愛因斯坦說過：“科學與宗教不應該有抵觸。人單有科學，沒有宗教，不過是跛子；單有宗教，沒有科學，不過是瞎子。”這說法有幾個理據：一、人不能單靠科學尋獲聖經的神。“科學家單憑科學方法，不可能發現神、或證明神存在——但這證明不了什麽，不過證明他們采用的方法錯了。”
人除了普通啟示，也需要神的特殊啟示。詩篇十九篇頭六節描述神的普通啟示，後半篇描述神的特殊啟示(神的律法)。世人唯有藉著神的特殊啟示，才可以尋獲“我們主耶穌基督的父神。”
二、科學不能滿足人心底的需要。禾柏特(Lewis Wolpert)在英國《時報》(The Times)說：“沒有宗教信仰的科學家(或任何人)必須麵對這樣的一個世界：這世界沒有目標，也沒有方向；或喜或憂，沒有任何意義；或生或死，沒有什麽分別；人人死後一了百了，也沒有來生。”科學不能幫助人麵對世間的悲歡離合，不能幫助人處理道德疑難，也不能幫助人解決罪疚的煎熬。唯有藉著耶穌基督十字架代贖工夫，人才能夠識破上述疑團。
流行小說作家賀蘇珊(Susan Howatch)身家豐厚，香車豪宅綽有餘裕，不料後來婚姻破裂。她公開說：“神揪住我的後頸，把我拎了起來。”她後來信了基督。前陣子她捐出一百萬英鎊給劍橋大學，設立一席以“神學與自然科學”為題的教席，因為賀蘇珊深信科學與神學是“真理的兩麵”。
我們需要科學，也需要科學家，科學家對人類文明貢獻良多，但我們更需要基督教信仰，更需要耶穌基督。
