詭異的蝙蝠RaTG13。
直言簡評，2020-12-28.。
https://sites.google.com/site/zhiyanpage2/2020/z20201227-ratg13
推薦法廣報道：
《新冠病毒溯源：嚴防外人靠近的雲南通關蝙蝠洞引發關注》。
法廣，安德烈，發表時間： 28/12/2020 - 00:59。
自本次疫情在中國武漢爆發以來，就我看到的中文版歐美主要媒體的報道評論，法廣那篇報道最詳實地闡明了國際學界關於蝙蝠RaTG13樣本及其病毒基因數據來曆不明的不同見解的來龍去脈。
中國武漢封城前三天、大陸主管部門官員公開承認疫情病毒可人傳人之日，即2020年01月20日，中國武漢病毒所石正麗團隊發出論文，指明導致疫情的新冠病毒的病源是他們在雲南發現的蝙蝠RaTG13，主要根據是該蝙蝠攜帶病毒與武漢病號樣本病毒的同源相似度為96%。
論文與當年二月初發表，遭到國際學界質疑：基因序列說明該樣本采集時間是2013年07月24日，為啥六年半之後、恰好疫情規模爆發之後，才拿出來說道道？既然該蝙蝠是病源，那是否是武漢病毒所泄漏而導致疫情？
武漢病毒所一位負責人王延軼，先是給那些質疑扣個【陰謀論】帽子，然後回答說：【可能很多人都會有一個誤解：既然武漢病毒所報道了RaTG-13和新冠病毒基因組的相似性，那麽武漢病毒所就有這種病毒。但實際上不是這樣的，我們隻是在對蝙蝠樣本進行測序的過程中知道了RaTG-13病毒的序列信息，但並沒有去分離和獲得過RaTG-13活病毒，所以也就不存在泄漏RaTG13的這樣一個可能。】
那位負責人回避的問題是：為啥大體同期同地區的其它蝙蝠攜帶病毒與病號樣本的相似度都是80%左右或低些，而偏偏是蝙蝠RaTG13的病毒就有96%的超高相似度？這個蝙蝠病毒S-基因同源檢索的結果不是自然蝙蝠病毒、而是專利或人工嵌合體，咋回事？
夏季，本人推特有則匿名者給我的留言（並附帶現場照片）說：他們用了一段時間，按照石正麗團隊論文所說而重複石正麗團隊作業，在石正麗他們采集蝙蝠RaTG13的地方、試圖采集到攜帶同類相似度的蝙蝠樣本，結果失敗。不幸的是，我的推特賬號被封閉，圖片被刪除，現在無法顯示那則留言和照片。據BBC和法廣報道，石正麗團隊采集蝙蝠RaTG13的地方已被封閉、不許外人進入。
麻省理工一位CHAN某博士發文，通過基因比對和醫學方法，對蝙蝠RaTG13病毒基因樣本的可靠性提出質疑。結果，她遭到一些【主流媒體】操著武漢病毒所負責人腔調的猛烈抨擊和個人攻擊。請那些媒體及其作者拿出學術分析說明該基因比對錯在何處而要搞輿論轟炸攻擊，他們溜之乎也。
簡言之，關於蝙蝠RaTG13及其病毒樣本的來曆，國際學界、主流媒體乃至相關主管部門采取的是政治化一言堂即隻許說它是病源的做法，而對不同意見或質疑則采取封殺或扣個【陰謀論】帽子搞攻擊.。
到今年11月，出現了一些值得關注的變化。譬如，美國國家科學院刊物發文，就病毒病源問題，提出要允許不同聲音；有些媒體發表了質疑蝙蝠RaTG13的論文。
與此並行，提供該蝙蝠樣本數據的中國武漢病毒所石正麗團隊也有動作。譬如，11月24日，他們更新了一月20日發出的論文所提供的蝙蝠RaTG13的基因序列數據。使用美國衛生部數據庫BLAST，將更新版與首版序列比對，結果：長度一樣，相似度為99%，有個長度15個基因的片段變異。具體如下：
RaTG13: 20200324 x 20201124。
Query Length：29855。
Subject Length：29855。
Identities：29834/29870 (99%)。
Gaps：15/29870 (0%)。
| Query 1 CTTTCCAGGTAACAAACCAACGAACTCTCGATCTCTTGTAGATCT 45 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
| Sbjct 1 ATTAAAGGTTTATACCTTTCCAGGTAACAAACCAACGAACTCTCGATCTCTTGTAGATCT 60 |
| ：： |
| Query 29806 GTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 29855 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
| Sbjct 29821 GTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAA 29855 |
其中，20200324/Query為首版，20201124/Subject為更新版。
可以看到，更新版基因序列的起始多了15個BP【ATTAAAGGTTTATAC】、而尾部剛好就少了15個BP的【A】。這就有問題要問問武漢病毒所負責人王延軼了：
第一個問題：既然您說【我們隻是在對蝙蝠樣本進行測序的過程中知道了RaTG-13病毒的序列信息，但並沒有去分離和獲得過RaTG-13活病毒】，那麽，該病毒新版的那個15BP的基因變異或突變是怎麽發生的？就是把【序列信息】的符號ATGC做做文字版本的基因編輯嗎？如此，首版序列就不是文字符號編輯而來的嗎？
第二個問題：假設您單位擁有該蝙蝠攜帶的病毒的樣本，那麽，自然變異應該是隨機散漫的（譬如在英國剛剛發生的變異），為啥那個更新版的突變是如此定位整齊、且首尾變異的長度都是一樣的？若新版變異是實驗室人工的，那麽，首版序列就沒人工合成成分嗎？
第三個問題：該病毒變異或突變，不會憑白發生，而都是有個親和力和適應性的關係問題，且一個BP基因變異就會有足夠明顯的功能改變現象。如此，您那個新版的長達15個BP的【ATTAAAGGTTTATAC】、是親和力還是適應性的變異或突變？為啥不多不少剛好15個BP（翻譯為蛋白是IKGLY）？。
到目前，包括中國大陸在內的全球學界和醫學界乃至世衛組織，都把蝙蝠RaTG13作為導致本次超級規模的全球疫情的病毒病源看待。可是，該蝙蝠及其基因序列數據卻充滿了詭異成分，甚至稍微做做質疑都會被扣個【陰謀論】帽子而遭到學界媒體界的輿論轟炸或嚴酷封殺。這不是科學。這是為掩蓋真相的政治化的陰謀：以【辟謠】的名義造謠，早已泛濫；如此，以【陰謀論】的名義搞陰謀，也不新鮮。不知本次疫情中喪生的百萬在天之靈，是否看到了被稱為害死他們的蝙蝠RaTG13是如此詭異多端？
附件：中國武漢病毒所石正麗團隊提供的蝙蝠RaTG13攜帶的冠狀病毒基因序列兩個版本。
Bat coronavirus RaTG13, complete genome。
GenBank: MN996532.1。
29855 bp RNA linear VRL 24-MAR-2020。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN996532.1
Bat coronavirus RaTG13, complete genome。
GenBank: MN996532.2。
29855 bp RNA linear VRL 24-NOV-2020。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/MN996532.2
附件：武漢病毒所石正麗團隊關於更新版論文的聲明。
《自然》刊物發表於2020-11-17，發行於2020-12-03。該聲明解釋了該團隊如何發現了蝙蝠RaTG13及其攜帶的冠狀病毒，但沒有關於蝙蝠RaTG13攜帶的病毒的基因序列更新的解釋說明。
Addendum:
A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin。
Peng Zhou, Xing-Lou Yang, […]Zheng-Li Shi。 ..
Nature volume 588, pageE6(2020)。
The Original Article was published on 03 February 2020。
Published 17 November 2020/ Issue Date 03 December 2020。
鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-020-2951-z 。
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