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多國科學家日前在美國《國家科學院學報》上發表報告說,他們運用計算機模型“解碼”了艾滋病病毒在細胞間傳播的未知細節,有望為開發抗艾藥物找到新方法。
艾滋病病毒增殖的“訣竅”是迫使細胞在細胞膜上形成囊膜供病毒容身,囊膜脫落被稱為出芽,出芽後病毒體進入其他細胞展開複製,阻斷這一早期過程是治療艾滋病的一種可能方法。
中國北京大學和美國芝加哥大學等機構的研究人員建立了一個“粗粒化”計算機模型,揭示了一種名為HIV-1 Gag的蛋白質在細胞膜上可能的構象。這種蛋白是病毒的主要組裝蛋白,參與了出芽,但科學家一直難以運用實驗手段獲得分子層麵上組裝過程的清晰影像。
研究人員選擇在計算機中構造了這種蛋白的缺失部分,通過調試參數最終發現,這種蛋白利用病毒核糖核酸和細胞膜作為“腳手架”自行組裝起來。研究人員還發現,小核糖核酸可以抑製這種蛋白組裝。
論文作者、北京大學工學院生物醫學工程係陳匡時在接受新華社記者采訪時說:“借助計算機模型,可以模擬顯微鏡手段無法分辨的過程,且方便調試或增減參數。”通過計算機構建複雜的分子過程,醫生可以在實驗數據的基礎上進一步預測藥物效果。
論文通訊作者、芝加哥大學教授格雷戈裏·沃斯在一份聲明中說:“一旦抓住Gag蛋白組裝過程的弱點,就有望阻斷病毒增殖。這展示了現代計算機模擬的力量。”