從1805年的奧斯特裏茨戰役，到1807年的弗裏德蘭戰役，歐洲大陸的強國奧地利、普魯士和俄羅斯都一一敗在了拿破侖手下，他們共同簽署了《提爾西特和約》，向拿破侖表示認輸恭順。此時，拿破侖帝國的疆域西起大西洋，東到巴爾幹半島，北達波羅的海，南至意大利半島南部，除了遠在海島的英國和偏安一隅的土耳其外，整個歐洲大陸幾乎都在拿破侖帝國的直接控製之下。
拿破侖身為法蘭西皇帝，同時又是意大利國王、萊茵聯邦的保護人、瑞士的統治者。他的哥哥和幾個弟弟以及他的妹夫，分別被封為一些附屬國的國王，直接聽命於拿破侖。在曆史上，還沒有任何一位歐洲君主擁有過如此巨大的權力。
拿破侖野心勃勃，他想成為世界的霸主。在戰勝了歐洲大陸所有最強大的對手之後，隻有一個敵人還在頑抗，那就是英吉利海峽對麵的英國。拿破侖在陸地上是所向無敵的英雄，可是他對海洋卻沒有辦法。法國海軍不是英國海軍的對手，數次被打得幾乎全軍覆滅，拿破侖想渡過海峽征服英國的計劃，也因為沒有製海權而放棄。苦思之下，拿破侖決定以經濟封鎖來扼殺依賴海上貿易才能生存的英國。他簽署了著名的《大陸封鎖法令》，禁止法國及其所有盟國與附庸國同英國發生貿易。
在以後的幾年裏，英國發生了嚴重的困難。可是英國殖民地多，至少可以從別的地方得到需要的東西。但歐洲大陸國家卻無法再從海上貿易中得到許多必需品，因而產生了嚴重的不滿情緒。這其中，俄國的不滿最大。俄國沙皇亞曆山大一世是個年輕人，血氣方剛，對拿破侖騎在他頭上十分怨恨。他陽奉陰違，私下允許俄國商人和英國發生貿易，目的是向拿破侖施加壓力，表示自己的不滿。
拿破侖本人對沙皇亞曆山大一世更是非常看不上，認為他目空一切，卻毫無本事。1809年，拿破侖提出娶沙皇的妹妹為妻，亞曆山大一世對此反應冷淡，他無論如何不會答應有尊貴血統的妹妹嫁給一個科西嘉暴發戶。拿破侖對此還以顏色，還在和俄國宮廷協商過程中就宣布和一位奧地利公主訂婚，極大地刺激了好麵子的亞曆山大一世，兩國關係由此日漸冷淡。後來，拿破侖宣布解放俄國的附屬國波蘭，並大肆兼並一些俄國感興趣的領土，這進一步加劇了兩國關係的緊張。到了1811年底，拿破侖終於下決心教訓一下這個年輕的沙皇，更重要的是隻有徹底打敗俄國，才能真正地使歐洲大陸的其它國家俯首貼耳，最終讓拿破侖騰出手來對付英國。此時，《大陸封鎖法令》已是破綻百出，不要說各國的走私商人，就連法國也偶爾與英國有貿易往來。而拿破侖的後方也不穩定，大量法軍陷在西班牙半島的遊擊戰之中，英國也一直蠢蠢欲動，伺機反攻。但拿破侖的野心使他不顧一切了，他以俄國破壞《大陸封鎖法令》為借口，準備發動一場對俄國的討伐戰爭。
拿破侖傾全力投入對俄作戰的準備，他將能征慣戰的法國老兵從各地調回，聚集了27萬法軍及許多大炮。同時，拿破侖密令在德意誌、奧地利和波蘭大量購置馬匹，在東歐地區設置兵站基地，儲備糧食、彈藥等軍需物資，在附庸國征集糧餉。他還要求手下大量搜集有關俄國的地理書籍和戰史記錄供他研究，並派人調查俄國的兵要地誌、氣象資料，編譯複製俄國地圖等。拿破侖對此戰可以說是費盡心機，孤注一擲了。
拿破侖的不少顧問看出了進攻俄國伏下的危險，向他進言，但拿破侖根本聽不進去。他將法國高壓下的所有歐洲國家都動員了起來，逼迫普魯士和奧地利簽訂了同盟條約，協同出兵，使俄國處於更加被動的地位。沙皇亞曆山大一世此時也驚慌起來，但他那要強的自尊心不容許他向拿破侖低頭。相反，沙皇反而開始和英國、土耳其及瑞典秘密勾結起來，圖謀共同反對法國。1812年4月底，沙皇最後通諜式地要求法國撤走在普魯士境內的軍隊，這實際上是一次氣急敗壞的示威。拿破侖一口回絕，然後開始在俄國東部邊境集結軍隊，並親自移駕到普魯士的德累斯頓建立了大本營。到了6月初，法國大軍已全部趕到，再加上征調的各個附庸國的軍隊，足足有60萬人。這是一支說著不同語言的大軍，其中不但有法國人，還有德意誌人、波蘭人、意大利人、荷蘭人和瑞士人等。這支軍隊的龐大規模是歐洲曆史上前所未有的，顯示出了壓倒一切的氣勢。
1812年6月23日晚10時，拿破侖親自統帥60萬大軍及1400門大炮，帶著數萬輛大車和15萬匹軍馬，浩浩蕩蕩渡過涅曼河，開始了對俄國的討伐之戰。拿破侖兵分5路，命繼子歐仁親王和弟弟熱羅姆國王各領8萬軍隊，在他的右側後方跟進，以保護法軍的交通線；命法國麥克唐納元帥率3.4萬普魯士軍隊向北守衛波羅的海沿岸；命施瓦岑貝格元帥的3.4萬奧地利軍隊負責掩護法軍主力部隊的南側；拿破侖自己親率主力大軍30多萬人，從中路直插立陶宛突破俄軍防線，以尋找俄軍主力決戰。拿破侖過於自信滿滿，以前和沙皇交手的經曆令他對對手不屑一顧。因而他並沒有充分估計到在俄羅斯的荒原上將要遭遇到什麽樣的困難，認為隻要抓住俄軍主力打上幾仗，戰爭很快就會結束，根本不會拖到冬天。拿破侖命令軍隊帶上了盡量多的隨身軍需用品，卻並未重視大力加強軍隊的後勤補給。
與拿破侖的龐大兵力相比，俄軍則顯得比較單薄，沙皇隻能聚集起20多萬部隊。這些兵力的大部分約15萬人由俄軍總司令巴克萊將軍率領，部署在西部邊境的涅曼河附近；巴格拉季昂親王指揮5萬部隊，守衛在涅曼河和布格河之間地區；在這兩支軍隊之間，是普拉托夫將軍的8000哥薩克騎兵；另外還有托馬索夫將軍的3萬部隊，部署在西南邊境，以對付施瓦岑貝格的奧地利軍隊。
6月28日，拿破侖進占立陶宛首府維爾納（今維爾紐斯），邊境俄軍全部撤走。拿破侖立即揮軍直取巴克萊的軍團，同時命弟弟熱羅姆迅速進軍圍殲巴格拉季昂的部隊，隻要這兩支俄軍最主要的部隊被殲滅，那麽俄國就再沒什麽可憑仗了。不料熱羅姆接令後猶豫不決，行動拖延，導致巴格拉季昂的俄軍迅速撤退，脫離了險境。而麵對拿破侖的攻擊，巴克萊也避而不戰，率軍後撤至德裏薩河畔的營地堅守。巴克萊認為法軍勢大，不宜與其正麵交鋒。他力爭與巴格拉季昂的部隊互相掩護，竭力遲滯法軍的攻勢，從而拖垮後勤補給困難的法軍。
熱羅姆的行動遲緩使拿破侖圍殲俄軍主力的計劃告吹，他一氣之下撤掉了熱羅姆的職務，由法軍達武元帥接任。拿破侖本想乘勝進軍，可是該死的後勤問題此時來困擾他了。法軍人多，又遠離本土作戰，後勤補給線本來就拉得很長，運輸較為困難，供不上大軍的日常消耗。在以往作戰時法軍經常是就地取食，偏偏俄國人這次采取了堅壁清野的策略，法軍所過之處一片廢墟，即使大肆洗劫也得不到多少東西。而且俄國正值盛夏，不但酷熱難當，還經常大雨傾盆。俄國的土質道路一片泥濘，法軍行軍極為困難。因為糧食缺乏，喂牲口改用其他飼料，結果騾馬大批死亡，導致上百門火炮無法攜帶，隻好被迫丟棄。拿破侖不得不在維爾納滯留了18天，以等待後方的補給部隊。
7月中旬，法軍又進攻了。達武的軍隊很快攻占了第聶伯河上遊的重鎮莫吉廖夫，從而切斷了巴克萊和巴格拉季昂兩軍的聯係。拿破侖抓住這個戰機，命達武繼續追擊巴格拉季昂，自己則率軍直插兩軍之間的維捷布斯克，準備在這裏再次兜住巴克萊軍團。巴克萊見勢不妙，連忙後退到維捷布斯克以東的俄國故都莫斯科的門戶斯摩棱斯克。不久，巴格拉季昂的部隊也逃脫了達武軍的追擊，趕到這裏與巴克萊會合。沙皇亞曆山大一世認為拿破侖是想直取莫斯科，於是下令讓巴克萊等俄軍死守斯摩棱斯克。
拿破侖於7月28日攻占維捷布斯克，在這裏又停留了14天。一方麵因為拿破侖還不清楚俄軍主力的動向，另一方麵是法軍的境地日趨窘迫，戰線越拉越長，補給更加困難，俄國天氣惡劣，道路泥濘，法軍因傷病而大量減員。開戰1個多月以來，在沒有經曆什麽大戰的情況下，法軍已減員達13萬多人，馬匹也減少了8萬多匹。拿破侖意識到這次戰爭可能會很困難了，麵臨的形勢是以前從未經曆過的。但拿破侖是從不會向任何困難低頭的，他堅信隻要能抓住俄軍主力決戰，勝利還是自己的。8月12日，拿破侖得知俄軍主力已聚集於斯摩棱斯克，立即命各路法軍向東前進，直取斯摩棱斯克。
8月16日，法俄兩軍在斯摩棱斯克發生激烈戰鬥。法軍凶猛地向斯摩棱斯克堅固的城防和周圍高地發起進攻，俄軍用大炮和排槍堅決阻擊，法軍猛攻一天，傷亡很大。第二天，拿破侖集中了炮火向城內轟擊，引燃了城內的木質民房，很快城內一片大火熊熊。法軍奮勇登城，與俄軍展開了血腥的白刃戰。雙方反複進行拉鋸拚殺，城壕內外屍橫遍野。在法軍的一再猛攻下，斯摩棱斯克城防出現了多處缺口。為了不使全軍覆滅，巴克萊命俄軍燒毀了一切不能帶走的彈藥和物資，然後趁夜率軍沿通向莫斯科的大道東撤。
拿破侖占領了斯摩棱斯克，可是法軍又傷亡了近2萬人，卻還是沒能夠消滅俄軍主力，更沒有達到使俄國屈服的目的。此時已近8月底，俄國的秋天很快就要到來。看這個戰場形勢，即使法軍再向前進，俄國人還會繼續後撤到更遠的地方，恢複實力，繼續抗爭。那樣的話，最不想見到的冬季作戰就要到來了。現在拿破侖麵臨三種選擇：第一，收兵回國，但這是拿破侖永遠也不會考慮的；第二，在冬季堅守斯摩棱斯克一線，以便等到來年春天再重整大軍進攻俄軍；第三，立即前進，以迫使俄軍與法軍決戰。
這三種選擇中，在斯摩棱斯克過冬是最佳方案。此時法軍經長途行軍及戰鬥傷病已大量減員，再加上去還要分兵去保護兵站、補給點和交通線上的橋梁，拿破侖手中能夠作戰的部隊隻有不到17萬人。而且給養已消耗殆盡，食品越來越短缺，隨軍馬匹大量死亡，騎兵威力已大減，炮兵也因沒有馬匹拖曳而逐漸掉隊。除此之外，法軍還經常受到小股俄軍和遊擊隊的襲擾，弄得軍力疲憊，士氣衰退。法軍極其需要一段休整時間，以培養戰鬥力，重新發動攻擊。然而拿破侖考慮再三，還是決定孤注一擲，冒險東進。拿破侖認為，如果真的停止前進，就會給俄國半年多的喘息時間，沙皇就會利用這個時機抓緊動員和訓練新軍，並從英國得到物質上的援助。到時不但俄軍將比現在更強大，而且法國也難保不會後院起火，特別是拿破侖最放心不下的西班牙半島。唯有此，拿破侖才決心做一賭博，以抓住俄軍主力進行決戰作為這一世紀籌碼。8月29日，拿破侖率法軍主力離開斯摩棱斯克，沿通向莫斯科的大路向東進發。
此時，俄軍的形勢也出現了變化。從開戰以來巴克萊率軍一直不斷地撤退，從沙皇到各級將領都對他十分不滿。血氣方剛的亞曆山大一世希望能盡早將法軍趕出他的國土，所以他迫切想和拿破侖打上一仗。8月底，沙皇解除了巴克萊的職務，任命老將庫圖佐夫為俄軍總司令，並調動各路俄軍前來保衛莫斯科。庫圖佐夫時年67歲，一生從軍，曾與波蘭人和土耳其人作過戰，1805年又指揮俄軍與拿破侖在奧斯特利茨打過一仗。庫圖佐夫性格堅毅，眼光敏銳，是個優秀的統帥。雖然此時他已垂垂老矣，身體很虛弱，眼睛也瞎了一隻，但他還是毅然挑起了領導全軍的重任。
庫圖佐夫仔細分析了戰場形勢，認為可以和法軍打一仗。他準備以積極防禦的手段盡量殺傷敵人，改變敵我力量對比，為日後交戰和殲滅法軍保存實力。俄軍雖然一路敗退，但主力未損，對侵略者的痛恨使他們的士氣反而更加高昂。俄軍的騎兵部隊很精良，分為輕騎兵、重騎兵和龍騎兵，此外，俄軍還擁有數千名優秀的哥薩克騎兵，他們雖然不善交戰，但善於追擊、警戒和伏擊。俄軍的步兵相當英勇善戰，隻是裝備較差，在火力上和法軍比居於劣勢。不過他們堅信俄國元帥蘇沃洛夫的名言：刺刀比子彈更有用。俄軍炮兵也在新近進行了整編，配備了一批新武器。它規模龐大，包括44個重炮連和58個野炮連，在數量和質量上都高於法軍。手中有這樣一支部隊，庫圖佐夫對即將到來的會戰充滿了信心。作為一名大軍統帥，他也希望能與當世第一名將拿破侖真刀真槍地較量一場，分個高低上下。庫圖佐夫精心選擇了距離莫斯科120公裏的博羅季諾村作為戰場，這裏正位於斯摩棱斯克通往莫斯科的大道上。俄軍陣地正麵寬8公裏，右翼緊靠莫斯科河支流科洛查河；左翼與難以通行的烏季察森林相連；中央以低矮的庫爾幹納亞高地為依托，在上麵修築起了一座拉耶夫斯基棱堡作為防禦支撐點；主陣地後方有森林和灌木林，便於隱蔽配置軍隊和實施機動；在棱堡以南的俄軍左翼主要是平地、沼澤和叢林，俄軍在這裏主要以謝苗諾夫斯卡婭村為主要支撐點，附近還有3個小的防禦棱堡，以巴格拉季昂棱堡為主。庫圖佐夫認為法軍會沿新斯摩棱斯克大道推進，所以把兵力最雄厚的巴克萊軍團放在了陣地右翼；中央和左翼則由巴格拉季昂的部隊來防守。相對而言，巴格拉季昂的防線過長，從而給了法軍以可乘之機；在左翼主陣地前約2公裏，俄軍修建了一座舍瓦爾季諾棱堡，有1個師部隊防守。俄軍在博羅季諾陣地的總兵力為12.2萬人，大炮約為640門。
9月5日，拿破侖大軍抵達博羅季諾。拿破侖在巡視陣地時發現俄軍的舍瓦爾季諾棱堡位於左翼陣地之前，威脅著進攻法軍的側背。他立即命達武的部隊拔掉這一釘子。戰鬥從日落一直打到將近午夜，法軍終於攻占了這一棱堡，俄軍損失大約5000人，殘餘兵力退回主陣地。
9月6日，拿破侖再次巡視戰場，確定了兵力部署。因為兵力不足和地形限製，拿破侖沒有采用從側翼迂回俄軍的戰略，而是決定從正麵進行強攻。拿破侖命達武率第1軍進攻俄軍左翼的巴格拉季昂棱堡；內伊的第3軍在朱諾的第8軍的緊密配合下，以近衛軍為戰略預備隊，向中央防線的拉耶夫斯基棱堡南麵的謝苗諾夫斯卡婭村進行攻擊；歐仁的第4軍在科洛查河北岸作戰，其任務是摧毀博羅季諾村，然後利用3座特製的浮橋渡河，向拉耶夫斯基棱堡發動進攻；波尼亞托夫斯基的第5軍沿老斯摩棱斯克大道從側翼包抄俄軍左翼；繆拉則指揮第1、2、4三個騎兵軍，對中央和左翼俄軍進行決定性的一擊。因為法國大軍散布在漫長的進軍路線上，進攻博羅季諾的總兵力約為13萬人，大炮587門。可以看出，拿破侖已瞅準了俄軍中央和左翼防線的弱點，決心從這裏實現突破。
9月7日淩晨6時，法軍集中了所有炮兵火力，向俄軍陣地猛烈轟擊，俄軍也毫不示弱，還以炮火。雙方進行了長達幾小時的炮戰，整個戰場上沙石橫飛，硝煙彌漫，百米處不見人形。隨後，法軍在全線發起了進攻。達武的第1軍猛攻巴格拉季昂棱堡，俄軍炮兵猛烈開火，打得法軍屍橫遍地。其後俄軍步兵射出排槍彈雨，打亂法軍進攻隊形，雙方接著展開了殊死的肉搏戰。混戰中，達武的坐騎被擊中，他本人也被震傷，隻得撤下戰場，將指揮權交給法軍師長德賽。雙方反複拉鋸，法軍一度攻占了俄軍陣地，但在俄軍援軍的反攻下，又被趕了出來。德賽重新集結法軍，再次向巴格拉季昂棱堡發動猛攻，繆拉元帥的騎兵也加入了戰鬥。整個戰場上到處都是大炮對轟、刺刀拚殺和騎兵肉搏。雙方軍隊瘋狂地在陣地上一次次撞擊，拚死廝殺。戰鬥中，左翼俄軍主將巴格拉季昂親王中炮負傷，2周後死去。法軍不顧傷亡地一次次發起衝鋒，終於奪取了2座棱堡，並毫不留情地猛攻主棱堡。戰鬥一直持續到了中午，經過連續8次攻擊，法軍終於攻占了巴格拉季昂棱堡。
在法軍進攻巴格拉季昂棱堡的同時，波尼亞托夫斯基的第5軍也向俄軍的左翼防線進行了迂回。上午8時，雙方軍隊展開了激戰。因為俄軍部分兵力被抽去支援巴格拉季昂棱堡，法軍很快攻占了烏季察村，並繼續向縱深挺進。庫圖佐夫急忙從右翼抽了1個軍趕過來，頑強阻擊法軍。經過激烈戰鬥，法軍的攻勢被遏阻住了，但俄軍指揮官圖奇科夫也在戰鬥中陣亡。
在俄軍右翼，歐仁親王率領法軍第4軍向博羅季諾村的巴克萊部隊發動攻擊。雙方進行了幾個回合的爭奪，小有傷亡後，俄軍主動退回了主陣地。法軍占領了博羅季諾村，然後於上午9時30分架浮橋渡過科洛查河，開始進攻拉耶夫斯基棱堡。法軍先以大炮猛烈轟擊棱堡，給堅守在棱堡後方的俄軍騎兵以巨大殺傷。稍後，法軍步兵奮勇衝向棱堡。守衛在這裏的俄軍因分出了一些軍隊去支援自己的左翼，因而陷入一場苦戰。法軍的第一次進攻在俄軍的排槍炮火下被擊退了，但很快又發動了第二次進攻。法軍不顧死傷，以方陣隊形踏過彈雨，頑強地攻進了棱堡。雙方士兵立即進行了麵對麵的殊死搏鬥，棱堡裏到處是刀光劍影，喊殺聲震天動地。經過幾度的白刃格鬥，俄軍將法軍趕出了陣地。拿破侖見狀，立即將格魯希的第3預備騎兵軍投入了戰鬥。法軍騎兵高舉著馬刀，殺向俄軍陣地。俄軍立即結成步兵方陣，以密集的排槍火力射擊，一時間彈落如雨，法軍騎兵被打得人仰馬翻。法軍又連續發動幾次進攻，一直血戰到接近中午，卻還是沒能攻占拉耶夫斯基棱堡。為了扭轉右翼的被動局麵，庫圖佐夫派出了1個騎兵軍和頓河哥薩克騎兵共8000餘人，渡過科洛查河向法軍占領的博羅季諾村發動進攻。法軍一支騎兵衝上去進行戰鬥，很快被俄軍騎兵打散。留守博羅季諾村的法軍1個師立即結成方陣，以密集火力阻擊俄軍騎兵。經過1個多小時的激烈交戰，俄軍損失很大，不得不放棄了攻擊。
在左右兩翼激烈戰鬥的同時，拿破侖命達武和內伊的部隊聯合向拉耶夫斯基棱堡以南的謝苗諾夫斯卡婭村地區發起了攻擊，朱諾的第8軍和法軍騎兵也參加了戰鬥。法軍照例先對俄軍實施猛烈炮轟，然後法軍騎兵和步兵排成整齊的方陣向俄軍陣地發起進攻。俄軍炮兵毫不客氣，將炮彈密集地傾泄在法軍頭上。隨後俄軍的龍騎兵刮風一般衝向法軍，雙方騎兵像兩道長牆一樣撞在一起，雪亮的戰刀立即叮叮當當地撞擊成一片。在騎兵拚殺的同時，俄軍步兵也殺出陣地，與法軍步兵展開了刺刀見紅的白刃戰。在這場舉世罕見的血戰中，雙方士兵都表現出了極大的勇氣和果敢。內伊元帥奮勇當先，親自率軍衝入敵陣，在最關鍵的時刻頑強苦戰不退，戰後被拿破侖授予莫斯科親王封號。大混戰一直進行到了中午，在一片屍山血海中，謝苗諾夫斯卡婭地區終於陷落在法軍手中。此時法軍一線部隊也傷亡慘重，無力再繼續擴展戰果。內伊和繆拉向拿破侖緊急求援，以期在俄軍立足未穩之時一舉攻破俄軍的防線，這樣便很可能贏得這場戰役。然而，拿破侖猶豫片刻後拒絕動用他的近衛軍參戰。事後證明，博羅季諾戰役不可能使法軍取得決定性的勝利，而近衛軍是全軍的中堅，在任何時候都是堅定可靠的，在日後的法軍大撤退中這種可貴作用就充分顯示了出來。法軍沒有乘勝挺進，俄軍很快就調集兵力穩住了中央防線。
這場殘酷的戰役不可避免地要持續到下午了。整個戰線上，法軍還需要攻克拉耶夫斯基棱堡。俄軍占領這裏，就可以對左右兩翼的法軍形成縱深威脅。因為俄軍騎兵對博羅季諾村的襲擾，歐仁親王重新調整了兵力，直到近下午3時，才再一次對棱堡進行了大規模進攻。為了配合法軍進攻，占領謝苗諾夫斯卡婭和博羅季諾的法軍炮兵集中優勢炮火對拉耶夫斯基棱堡實施了交叉火力封鎖。法軍騎兵和步兵再次以排山倒海之勢衝向俄軍陣地，俄軍在猛烈炮火阻擊後，也殺出陣地，重演了千軍萬馬的肉搏拚殺。雙方都在此耗盡了全力，一隊一隊的步兵和騎兵投入到這場大戰中，戰場上到處都是喊殺聲、兵刃撞擊聲、傷者哀嚎聲和戰馬嘶鳴聲。法軍頑強推進，一步步擠進了棱堡。殺紅了眼的法軍到處追殺俄軍炮手，棱堡內屍橫遍野，慘不忍睹。下午4時左右，法軍終於拿下拉耶夫斯基棱堡。其後，歐仁親王在棱堡後的高地上集結了所有可動用的騎兵，又凶猛地向準備反攻的俄軍殺去。在這一天的最後一場惡戰中，雙方的騎兵、步兵和炮兵反複攻殺，人屍馬體鋪滿了棱堡後的高地。
戰鬥一直持續到入夜，俄軍終於支持不住，一麵拚死抵抗，一麵逐漸向後方退去。法軍也筋疲力盡，拿破侖沒有下令追擊。第二天清晨，庫圖佐夫將部隊從戰場上撤了下來。俄軍付出巨大代價，仍然沒有擋住法軍，又沒有預備隊補充，隻好退向莫斯科。
博羅季諾之戰，雙方的傷亡都異常慘重。俄軍傷亡4.4萬人，被俘千餘人，損失大炮40門；法軍傷亡3.6萬人。雙方還傷亡了大批的高級將領，俄軍有22人，法軍則有38人。會戰結果，俄軍阻擋法軍的目的沒有達到，同樣，拿破侖殲滅俄軍主力的目的也沒有達到。
庫圖佐夫率軍撤退到莫斯科後，為了保存實力，放棄了這座城市。幾十萬市民也爭先鞏後地逃離了這裏，城內的所有糧食物資被搬運一空，整個莫斯科幾乎成了一座空城。9月14日下午，繆拉率領的第一支法國軍隊進入了莫斯科城。次日，拿破侖也洋洋得意地進駐了克裏姆林宮。15日入夜，不知什麽原因，可是能莫斯科人故意縱火，也可能是法軍搶劫時放的火，反正是莫斯科滿城燃起了大火。因為俄軍撤退時破壞了一切消防設施，法軍想滅火卻無能為力。熊熊大火四處蔓延，吞噬了大半個城區。這場火直燒到20日方息，城中7000多座房屋中有6000多座被燒毀，莫斯科這座俄國故都幾乎化為了一片瓦礫。拿破侖得到了一座殘破的莫斯科，卻一點用也沒有，不能消滅俄軍主力，戰爭還是無法取勝。
庫圖佐夫率軍撤出莫斯科後，來到了莫斯科西南160公裏處的卡盧加城。不久，各路俄軍匯集而來，他的部隊擴充到了10萬多人。庫圖佐夫立即調整部署，與俄軍眾將領相約四麵向法軍出擊。俄將維特根斯坦率5萬俄軍威脅法軍的左翼，奇恰戈夫率軍7萬出擊法軍的右翼，前鋒已到法軍補給基地明斯克附近。俄國老百姓也與拿破侖做對，不但藏起了所有的糧食，還組成了許多股遊擊隊，到處襲擊法軍小股部隊和輜重隊，使法軍後方到處陷於不安之中。
拿破侖占領莫斯科後，本以為沙皇會主動來求和，他也好乘機從這場戰爭中脫身。不料等了又等，沙皇竟無動於衷。這時，後方又傳來壞消息，西班牙戰場的法軍出現了全麵潰敗，連馬德裏都丟了。法國國內情況也不穩定，保王黨人蠢蠢欲動。而且法軍的補給線也連遭俄軍襲擊，隨時都有被切斷的危險。拿破侖再也等不下去了，他主動向沙皇提出了媾和，但亞曆山大一世對此無動於衷，他已決心用戰爭的全勝來洗刷俄羅斯所遭受的恥辱。結果拿破侖在莫斯科白白呆了4周，徒勞無益的求和談判，什麽事也沒幹成。進入10月後，天氣越來越冷，俄羅斯的冬天就要到來了。拿破侖意識到再耽誤下去隻有坐以待斃，他終於下決心撤退。
10月19日，拿破侖率10萬法軍和500多門火炮撤離莫斯科，臨走時還帶著上萬輛滿載劫掠物資的大車，浩浩蕩蕩的隊伍竟長達30多公裏。此時，庫圖佐夫的部隊已休整補充完畢，立即向拿破侖大軍撲來。10月24日，俄軍在馬洛雅羅斯拉維茨迎頭攔阻法軍。雙方展開一場惡戰，一天之內馬洛雅羅斯拉維茨易手8次。法軍損兵5000餘人，終於奪取馬洛雅羅斯拉維茨。拿破侖為了報複俄軍，下令所過之處也把沿途的鄉村和莊園燒個精光。在經過博羅季諾戰場時，俄軍和法軍幾萬具屍體還沒有掩埋，已經腐爛，情景十分恐怖。在撤往斯摩棱斯克的路上，法軍不但饑餓疲憊，還每天都要遭到哥薩克騎兵的襲擊，一路損兵折將，鬥誌盡衰。此時，北路的普魯士軍隊和南路的奧地利軍隊見勢不妙，已早早撤走了，法軍部隊更加孤立。
11月3日，法軍與緊追的俄軍在維亞茲馬又大戰了一場，雖然擊退了俄軍，但傷亡達5000餘人。11月5日，俄羅斯開始降雪，氣溫迅速下降。法軍在撤離莫斯科時根本沒有預料到要在冰天雪地中行軍，沒有帶足防寒保暖用品，加上糧草殆盡，饑寒交迫，秩序開始大亂。法軍三五成群地到處搶劫，以尋找食物和燃料，隻要有一匹馬倒下，大家就瘋狂地衝上去搶食，許多人常常為了爭奪一塊麵包和一個土豆而發生自相殘殺。俄軍的騎兵不時衝來，砍殺一頓後又迅速消失。法軍一路棄屍無數，大量的人開了小差，很多傷病員被丟下，連裝滿劫掠物資的大車也丟在路邊無人問津。11月9日，拿破侖終於退到了斯摩棱斯克，跟隨的部隊已隻剩不到6萬人。因為法軍的馬匹在馬蹄上沒有安裝防滑釘，在雪地上非常容易摔斷腿，加上在嚴寒中凍死的，至此已所剩無幾，許多大炮和彈藥車不得不丟棄。11月14日，這支已凍掉了靈魂的部隊繼續向西撤去。在衝過第聶伯河時，又與俄軍發生激戰，經過艱難苦戰才殺出重圍，許多法軍士兵被殺死和掉入河裏淹死。
此時，奇恰戈夫的俄軍已攻占了法軍補給地明斯克，拿破侖在這裏休整的計劃破滅，隻好再向北撤往立陶宛的維爾納。在零下30多度的嚴寒中，腹內無食、衣著單薄的法軍每天都有上千人倒在雪地中，很快就被厚厚的積雪所掩埋。拿破侖經常下馬和士兵們一起步行，法軍士兵仍然對拿破侖保持著令人感動的忠誠。在宿營時，冷得發抖的戰士紛紛捐出極其珍貴的幹柴，說：“拿去給皇帝吧。”經過千辛萬苦，法軍撤到了別列津納河邊，河上的橋梁卻已被俄軍焚毀。俄軍把守對岸，法軍無法重建橋梁，而且天氣驟然回暖，冰河開化，法軍又無法從冰上衝過去。在生死危亡的時刻，拿破侖暗渡陳倉，佯裝要在原地架橋，暗中派部隊前往上遊，驅散少量哥薩克騎兵，奪取了一個架橋地點。法軍工兵在冰冷的河水中頑強奮戰，終於在11月25日架起了二座浮橋。法軍士兵立即爭先恐後的蜂擁過橋，結果一座浮橋被壓塌，很多人掉進了冰水中。人們更加瘋狂地擁向另一座橋，連擠帶踩拚命向對岸逃去，又有很多人被擠入河裏。此時俄軍已從三麵向這裏攻來，還架起大炮向河麵猛轟。許多法軍士兵情急之下跳進河裏泅渡，然而河水太冷了，這些人很快被凍僵。第二年河水退落後，在河道上露出了約1.2萬具法軍屍體。極度混亂中，拿破侖的近衛軍拚死阻擊俄軍，保護著拿破侖退過別列津納河。11月29日，法軍後衛部隊過河之後，立即將橋焚毀，總算逃脫了俄軍的追擊。河的東岸還留下了1萬多掉隊的法軍，除了凍餓而死的外，都成了俄軍的俘虜。
12月5日，拿破侖到達立陶宛，他將部隊交給繆拉統領，自己輕裝經華沙趕回巴黎。12月14日，內伊率領最後一批七零八落的法軍撤過涅曼河，這時已隻剩2萬多人。至此，拿破侖發動的侵俄戰爭終於結束。
在這場舉世矚目的大戰中，拿破侖的侵俄大軍死傷被俘近50萬人，其中法軍20餘萬，損失大炮1000多門，馬匹10萬多匹。俄軍也傷亡慘重，但他們取得了最後的勝利。
侵俄戰爭失敗後，拿破侖原來的盟國普魯士和奧地利等紛紛背叛，和俄國、英國共同組成了第6次反法聯盟，再次向法國發動了進攻。
拿破侖東征俄國是19世紀最重要的戰爭之一，這場戰爭宣告了拿破侖帝國走向末日，有著劃時代的曆史意義。
拿破侖在這場戰爭中低估了俄國軍民的反抗精神，並沒有充分做好戰爭準備，這是失敗的最重要原因。在戰術上，拿破侖在博羅季諾會戰中不肯投入近衛軍，這一點向來存在爭議。筆者認為，拿破侖的決定是對的。在博羅季諾那樣性質的戰役中，使用近衛軍也不過是徒然消耗而已，並不會有決定性的意義。問題的關鍵是，對俄國這樣廣大的國家，是絕對不應該進攻的，拿破侖從一開始就錯了。
