James D. Watson 在公開場合發表種族主義言論最廣為人知的一次是在 2007 年。當時他接受英國《The Sunday Times》采訪時說:「我們的社會政策基於一個假設,即(黑人)智力與我們一樣——而所有測試都說並非如此」「與黑人員工打交道的人會發現這不是真的」。
此外,他在 2000 年 的一次會議中也作出有關膚色、欲望強度與智力差異的爭議性言論,例如將黑皮膚與較強的性欲聯係起來。