文革中， 對文科生，都很不客氣。

1961年2月，李佩先生調入中國科學技術大學，擔任外語教研室英語教師。

“文化大革命”中，李佩先生受到較大衝擊，被隔離審查長達6年多。1968年12月5日，郭永懷先生不幸因公殉職。 [2] 

1970年2月，李佩先生隨中國科大南遷至安徽省合肥市。

從1970年到1973年底，她在科大接受隔離審查，監督勞動，不能工作，來往的信件也要被檢查，隻是沒人貼她的大字報。 [4] 

1976年暑假，李佩奉調回北京。

1978年4月，出任新成立的中國科學技術大學研究生院（後改稱中國科學院研究生院，即今中國科學院大學前身）外語教研室主任。 [2] 

李佩和郭永懷及女兒在中關村家中

1980年12月，李佩先生正式加入中國共產黨。

1984年，李佩先生將自己著書所得的200元稿費全部交作了黨費。