閻顏之爭:大部分人都忽視了這個事實

來源: 橫山杠的白眼王子 2022-11-10 05:30:48 [] [博客] [舊帖] [給我悄悄話] 本文已被閱讀: 次 (1654 bytes)

這個事實就是:單從蛋白質結晶體X光衍射數據解析出來的蛋白質3維結構是靜態模型,無法推導出動態的功能機製。

閻潤濤文章(Cell,1993;PNAS,1995,92:5973)描述了他們用氨基酸點突變進行半胱氨酸掃描實驗的結果,發現TM7片段中260-282位置的氨基酸在喇叭口“開”與“關”的過程中起重要作用。

 

 

顏寧的Nature文章(Nature 2014,510:121)主體有六個部分:

  1. Structure determination of GLUT1
  2. Implications for ligand binding
  3. Mapping of disease-related mutations
  4. Critical role of the ICH domain
  5. The extracellular gate
  6. Discussion

1是顏寧實驗室用蛋白質結晶體X光衍射數據解析出的蛋白質3維結構描述

2-5都是在用這個3維結構解釋已發表文章中GLUT1蛋白的各種氨基酸突變帶來的功能變化。文章中提到TM7片段裏Tyr 292, Ser 294 and Thr 295的作用,但是並沒有討論閻的文章中260-282位置氨基酸的作用

6 在1-5基礎上總結出一個動態模型

顏文章模型的關鍵在於TM7片段的“開”與“合”。沒有引用閻的文章,如何能夠推斷出TM7片段在喇叭口的作用?這在邏輯上是非常不合理的。

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