看了你給的link

我覺得文章中用pShuttle-SN complete sequence 去做blast 不對。當pShuttle-SN 和Vira vector recombine 了以後, pShuttle-SN 的大部分sequence 都消失了。這樣做出的結果沒有用。他們應該用ITR-SN-ITRsequence 去blast。SN 隻占pShuttle vector 的一小部分。用整個vector去比當然相關性小了。