商業化的維生素B2有不同的來源，有微生物發酵產生的，還有大多數以石油為原料化學合成的，後者長期服用可能適得其反。

最好的來源是，當然是天然食物中如發酵食品和動物內髒等，以及人體腸道內自身的細菌合成的，後者產生的量大且利用好，甚至還能製造對健康更重要的維生素K2。