MRI 在檢測“質子密度很高”的器官時效果很好,例如大腦、脊髓和肌肉骨骼係統,因為這些器官具有大量水分子(水分子中富含質子,即氫原子核),MRI 通過氫原子核的共振來生成圖像,能夠提供對這些複雜結構的詳細可視化,從而發現疾病。