請教同一個公司網址申請不同職位的問題

我已經在一家公司的網址申請了一個職位A，但是還沒有任何回複。

我想在同一家公司的網址申請另一個職位 B， 請問 當我申請B 的時候 要上傳 B的 resume ,cover letter， 就會把A的 resume ,cover letter  replace 了， 這樣對方公司的HR 還會有我 A 的 application material 嗎？ 會影響我的申請嗎？

謝謝