但不久飛來橫禍,1805年奧斯特裏茨戰役後,俄法兩國艦隊在拉古薩海麵相遇,俄軍圍困拉古薩數月,3000多發炸彈射進城內。法軍表示願意協助解除封鎖,條件是法軍自由通過杜城,並承諾不會軍事占領,杜城人答應了。然而法軍欺騙了拉古薩,他們封鎖了港口,1806年5月26日法軍開進拉古薩。1808年1月31日,法軍統帥馬爾蒙(Auguste de Marmont)宣布取消拉古薩共和國,拉古薩並入法國行政區。存在了450年的拉古薩共和國滅亡了。
雖然弱國無奈屈服於強權,但拉古薩的國家格言Non bene pro toto libertas venditur auro(自由勝過黃金)幾百年後依然回響在杜城人的耳畔,也讓他們有勇氣在20多年前,麵對塞黑聯軍的攻擊,即使很多古建築在炮火下灰飛煙滅,也堅決不投降。