也談談 Delta 病毒
文章來源: 遍野無塵2021-07-04 20:03:43

一種病毒大體可有三種特征:傳染性,致病性和抗免疫性能。這三種特性有時候很難分開,因為一種變異可能導致病毒一種特性或者多種特性的變化。如果傳染性增加,其他變化不大,其結果就是染病的人多一些。致病性就不一樣了。致病性增加,重症患者增多,會讓醫療係統不堪重負。新冠的致病性應該主要由它的S蛋白引起(當然這是筆者的個人看法)理由是注射疫苗後在人體中僅僅生成了S蛋白,並沒有病毒的其他組成成分沒,但是人體的反應幾乎等同感染了新冠後的許多症狀。當然各種症狀都很輕,因為S蛋白的濃度很輕很有限,不像真正的感染,S蛋白的“供應”源源不斷那樣。抗免疫性就是現有的抗體對病毒的中和能力下降或者消失。 

傳染性高有兩個表現,第一,少量的病毒(吸入)就會導致感染,第二病毒進入人體後能很快複製自己,因此能在較短的時間內成為傳染源。新冠病毒進入人體後, 首先要和人體細胞表麵的受體(ACE2)結合。這個結合是動態的,就是說結合後,又會分開,分開後,又會再結合,再分開,這是一個平衡過程。有一個常數(Kd)衡量結合的緊密程度。野生的新冠Kd大約為75nM(呐摩爾)。如果病毒濃度低於75nM,則病毒處於閑散狀態。這時,如果人體的免疫係統發達,從身體其他部門兼程趕來的免疫細胞,就會消滅這些外來的入侵者。如果病毒(S蛋白)超過這個濃度,就有一部分病毒和人體細胞的受體結合。和受體結合僅僅是第一步。第二步,病毒要進入細胞,利用人體細胞的複製能力繁殖自己。

新冠病毒的S蛋白有兩個單元:S1和S2。S1負責和人體的受體(ACE2)結合,S2 負責在人體細胞表麵打洞,當S2打好洞後,在整個病毒顆粒就會進入人體細胞。這兩個單元是連接在一起的,隻有當S1 和ACE2結合後,病毒就會利用人體細胞表麵的剪切酶把S1和S2剪開。據說剪切的快慢會影響的病毒進入細胞的效率。記得去年有印度人在網上登出一篇文章,說是在S1和S2之間有一個插入了的小片段PRRA。因為有了這個小片段,弗林蛋白酶工作的效率會更高。據此,他們稱,這個病毒是人造的。為什麽有了這個小片段剪切酶的工作效率會增高?R是精氨酸的代號,它帶一個正電荷。當兩個精氨酸(正電荷)在一起 蛋白片段就會張開,形成一個環狀。如同剪斷拉緊了的繩子一樣,弗林蛋白酶的工作自然容易得多。 

好了,應該說說這個舉世聞名的Delta病毒了。這個變種有什麽特點?Delta變種有許多點為變異,T19R, G142D, 156del, 157del, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N。前五個在結構區,一般認為對病毒的性質影響不大,因為結構區的變化,很少會影響到S蛋白和人體細胞表麵的受體 (ACE2) 的結合能力。所謂的結構區,也就是搭個架子而已。好像一個人的腿受傷了,不會影響他的坐在鍵盤前的打字能力一樣。 

L452R, T478K屬於和受體結合區部位,影響比較大。但是也不是特別大的影響,據報道 L452R, T478K兩個合在一起,和ACE2的結合常數大約在57nM 左右,相比野生的新冠病毒RBD的結合常數75nM,雖然小了一點,不算很出格。那麽Delta病毒的高傳染性該怎麽解釋? 很可能是由於P681R。前麵提到的PRRA中的P就是這個681處的。現在那個能提高弗林蛋白酶工作效率的PRRA就成了RRRA. 同樣的道理,如果PRRA能提高剪切酶的效率,沒有任何理由懷疑RRRA能進一步提高剪切效率。所以Delta病毒的高效複製就是自然的了。據說原來野生的新冠病毒的潛伏期大約是7-10天左右。現在據說這個Delta病毒的潛伏期縮短為4-5天。可能的原因是病毒進入人體的速度快了,複製的周期縮短了,發病“及時”了。如果以前懷疑PRRA是人為插入的,是否現在要進一步懷疑這個P681R是什麽人的“傑作”? 我看不是,原來的所謂人為插入也是扯淡。

好在雖然Delta病毒具有很高的高傳染性,但是現在的主要幾個疫苗還管用,雖然保護效率也降低了許多。就是說疫苗所用的抗原和Delta病毒的抗原差別不很大。不像南非的那個beta變種,簡直算是“男變女妝”,或者“變性”了,大約有少一半左右的疫苗所產生的抗體 對於beta變種完全無效(認不得了)。此外,beta變種和ACE2 的結合能力更強,而且現有疫苗的效率大大的降低,好在南非那個變種的傳染性沒有這個delta 厲害。如果將來有一天delta和beta 組成了新的聯盟,人類就要抓瞎一段時間了。